O menu de Configurações contém diversas áreas para realizar todas as configurações necessárias para que o sistema Geonave opere de acordo com as especificações recomendadas pelo usuário, em determinada operação do ciclo agrícola. Neste menu, o usuário configura os parâmetros da máquina agrícola, do operador, do implemento, e do próprio monitor Geonave, além de gerenciar arquivos e a memória do sistema.
A seguir são apresentadas imagens do menu de Configurações.